LSF-bsub命令

一、LSF(load sharing facility)

分布资源管理的工具，用来调度、监视、分析联网计算机的负载。
目的：通过集中监控和调用，充分共享计算机的CPU、内存、磁盘、license等资源。

一组安装了LSF软件的计算机组成了一个cluster。cluster内的资源统一监控和调度。

二、bsub命令

bsub [options] command [argument]
命令参数：
-q 选择队列
-i 指定输入文件
-o 指定输出文件，作业提交后标准输出信息会保存到这个文件中
-e 指定输出文件，作业提交后标准错误输出的信息保存到这个文件夹中
-n 指定作业需要的CPU核
-J 作业的名字
-m 丢job到指定的机器上
-I 交互式模式，此时终端不能输入
-lp 提交job的时候提供虚拟terminal支持,如vim这种应用是需要terminal支持的
-R 指定当前任务的资源需求
-W 限定作业运行时间

bsub -n x -q queuename -R rusage[mem=10240] -i inputfile -o outputfile COMMAND

其中x代表了提交作业需要的CPU数，-q指定作业提交到的队列，如果不采用-q选项，系统把作业提交到默认作业队列。任务需要10G内存，inputfile代表程序需要读入的文件名，outputfile代表一个文件，作业提交后标准输出信息将会保存到这个文件。 COMMAN则是用户要运行的程序
使用8个cpu运行任务

bsub -n 8 /.... run.tcl -8 -log flow.log

三、 常用命令

3.1 bhosts

利用bhosts命令可查看当前各节点的空闲情况

3.2 bqueues

利用bqueues可以查看现有队列信息

3.3 bjobs

利用bjobs可以查看作业的运行情况，bjobs | wc 统计总的job数

利用bjobs -u name可以查看用户下的具体任务

3.4 bkill

利用bkill命令可以终止某个运行中或排队中的作业，

[[email protected]] bkill 79726
Job <79722 > is  being terminated

3.5 bhist

bhist -a:查看已经运行完毕的作业信息

3.6 busers

利用busers可以查看用户信息