dplyr 中的filter报错：Can‘t transform a data frame with duplicate names

背景

处理一个数据框，用filter进行筛选数据时，发现了这个报错：

aa1 %>% filter(POS_strt == “20696”)
Error in filter():
! Can’t transform a data frame with duplicate names.
Run rlang::last_error() to see where the error occurred.

根据提示运行：rlang::last_error()，也没有看到问题所在：

> rlang::last_error()
<error/rlang_error>
Error in `filter()`:
! Can't transform a data frame with duplicate names.
---
Backtrace:
 1. aa1 %>% filter(POS_strt == "20696")
 3. dplyr:::filter.data.frame(., POS_strt == "20696")
Run `rlang::last_trace()` to see the full context.

在网上找了很久，终于解决了，总结一下。

问题解决

主要是因为数据框中的列名有重复，其实报错中也给出了：

! Can’t transform a data frame with duplicate names.

但是，我以为是rownames有重复，其实是colnames有重复，这里检查一下：

names(aa1) %>% duplicated() %>% table

可以看到，有一个有重复。

用make.names处理一下列名，重复的后缀加.1

nn = names(aa1)
names(aa1) = make.names(nn,unique = T)
names(aa1)

可以看到，图片中的红框部分，Chrom.1名称变了，这样处理后，就不会有重复了。测试一下：

搞定！

总结

tidyverse的数据框，不能有列名重复，否者filter之类的函数都不能使用。解决方案可以用base包中的make.names处理，进行重命名。