Nat. Comm. | 使用Tensor-cell2cell对细胞通讯进行环境感知去卷积

本文介绍由美国加州大学圣地亚哥分校生物工程系Nathan E. Lewis通讯发表在 Nature Communications 的研究成果：作者介绍了Tensor-cell2cell，这是一种基于张量分解的无监督方法，它通过同时说明细胞的多个阶段、状态或位置来破译上下文驱动的细胞间通信。为此，Tensor-cell2cell揭示了与不同表型状态相关并由细胞类型和配体-受体对的独特组合决定的上下文驱动的通信模式。Tensor-cell2cell有力地改进和扩展了现有工具的分析能力。作者发现，Tensor-cell2cell可以识别与明显通讯过程相关的多个模块，这些通讯过程与COVID-19严重程度和自闭症谱系障碍相关。因此，作者引入了一种有效且易于使用的策略来理解不同条件下的复杂通信模式。

论文链接：

https://www.nature.com/articles/s41467-022-31369-2

数据：

https://doi.org/10.24433/CO.0051950.v2

代码：

https://doi.org/10.24433/CO.0051950.v2 http://lewislab.ucsd.edu/cell2cell/