CADD课程学习（4）-- 获取没有晶体结构的蛋白(SWISS-Model)

SWISS-Model

同源建模原理

同源模建是预测蛋白质三维结构的一门技术，其基本假设是序列的同源性决定了三维结构的同源性。一个未知的蛋日质分子（自标蛋白）的结构可以通过与之序列同源且结构已知的蛋白（模板蛋白）来进行预测。

同源模建的主要目的是从其序列中预测结构，其精度与实验结果相似，提供了一种可行的成本效益替代方法来生成模型。
随着实验确定结构数量的增加，同源模型构建的作用和可靠性将继续增加。
同源模建是研究配体受体相互作用、酶-底物相互作用、诱变实验、引导优化、环结构预测和识别命中的强大工具。

同源建模原理

同源建模基本步骤

1.模板的确定；
2.单序列或多序列比对；
3.基于模板3D结构的靶标模型构建；
4.模型优化；、
5.模型验证。