当前位置:网站首页>lefse分析
lefse分析
2022-07-01 18:35:00 【全栈程序员站长】
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。
LEfSe(LDA Effect Size)分析,可以用于两个或多个分组之间的比较,从而找到组间 有显著性差异的物种(即 biomarker),分析步骤主要分为三步:
Step1:利用 Kruskal-Wallis 秩和检验检测所有的特征物种,通过检测不同组间的物种丰 度差异,获得显著性差异物种。
Step2:再利用 Wilcoxon 秩和检验检测上步获得的显著性差异物种的所有亚种是否都趋 同于同一分类级别。
Step3:最后用线性判别分析(LDA),得到最终的差异物种(即 biomarker)。
发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn/130825.html原文链接:https://javaforall.cn
边栏推荐
- What if the reliability coefficient is low? How to calculate the reliability coefficient?
- R语言使用dplyr包的transmute函数计算dataframe数据中的指定数据列的移动窗口均值、使用ggplot2包可视化移动均值与原始数据的折线图
- Lumiprobe non fluorescent alkyne EU (5-ethynyluridine)
- [CF1476F]Lanterns
- The 13th simulation problem of the single chip microcomputer provincial competition of the Blue Bridge Cup
- Li Kou daily question - Day 32 -589 N × Preorder traversal of tree
- Lumiprobe lumizol RNA extraction reagent solution
- Leetcode-141环形链表
- R语言epiDisplay包ordinal.or.display函数获取有序logistic回归模型的汇总统计信息(变量对应的优势比及其置信区间、以及假设检验的p值)、write.csv函数保存csv
- 主成分计算权重
猜你喜欢
NSI packaging script add file details
Lumiprobe biomolecular quantification - qudye Protein Quantification Kit
为什么独立站卖家都开始做社交媒体营销?原来客户转化率能提高这么多!
12. Design of power divider for ads usage record
Basic knowledge and commands of disk
After studying 11 kinds of real-time chat software, I found that they all have these functions
Lumiprobe Lumizol RNA 提取试剂解决方案
Using OpenSSL encryption to rebound shell traffic
Vidéos courtes recommandées chaque semaine: méfiez - vous de la confusion entre « phénomène » et « problème »
Salesmartly has some tricks for Facebook chat!
随机推荐
R语言ggplot2可视化:gganimate创建动态柱状图动画(gif)、在动画中沿给定维度逐步显示柱状图、enter_grow函数和enter_fade函数控制运动内插退出(渐变tweening)
12种数据量纲化处理方式
R语言caTools包进行数据划分、scale函数进行数据缩放、class包的knn函数构建K近邻分类器、table函数计算混淆矩阵
实现一个Prometheus exporter
Lumiprobe lumizol RNA extraction reagent solution
What designs are needed in the architecture to build a general monitoring and alarm platform
Rust language - cargo, crates io
每周推荐短视频:警惕“现象”与“问题”相互混淆
Calculation of intersection of two line segments
R语言使用epiDisplay包的followup.plot函数可视化多个ID(病例)监测指标的纵向随访图、使用n.of.lines参数指定显示的病例数
Leetcode203 remove linked list elements
Li Kou daily question - Day 32 -589 N × Preorder traversal of tree
[CF559E]Gerald and Path
GameFramework食用指南
Evaluation of 6 red, yellow and black list cameras: who is the safest? Who has good picture quality? From now on, let you no longer step on thunder
Blue Bridge Cup real question: score statistics
Sum of three numbers
Static timing analysis (STA) in ic/fpga design
LeetCode-21合并两个有序链表
Lumiprobe bifunctional crosslinker sulfo cyanine 5 bis NHS ester