（一）R语言入门指南——数据分析的第一步

注：本博客旨在分享个人学习心得，有不规范之处请多多包涵！

R语言

简单来说，R语言是一个免费开源、数据分析和可视化功能强大的编程语言。R语言的下载与安装请至R语言官网。下载完R语言后，推荐下载安装并使用RStudio这一开发环境。
下载完成后，打开RStudio，就会看到如下图的界面：

左边这部分是Console，可以直接输命令。如果想创建文件写代码的话，点开最左上角的下拉菜单即可选择。一般使用的是R Script文件。

接下来博主的操作可全部在Console里进行。

数值与逻辑运算符

用R进行计算很简单，只需在Console里打命令然后回车。
常用的数值运算符如下表所示：

符号	含义	举例
+	加法运算	5+3输出为8
-	减法运算	7-4输出为3
*	乘法运算	2*5输出为10
/	出发运算	10/4输出为2.5
^	指数运算	2^5输出为32
%%	模/取余运算	5%%2输出为1
%/%	整除运算	11%/%3输出为3

以下表格时常用的逻辑运算符：

符号	含义	解释	举例
==	等于	如果符号两遍相等，返回真	4==3输出为F
>=	大于等于	如果符号前大于或等于符号后，返回真	4>=3输出为T
<=	小于等于	如果符号前小于或等于符号后，返回真	4<=3输出为F
!=	不等于	如果符号两遍不相等，返回真	4!=3输出为T
>	大于	如果符号前大于符号后，返回真	4>3输出为T
<	小于	如果符号前小于符号后，返回真	4<3输出为F
&&	逻辑与	如果符号前后都为真，返回真	(4==4)&&(3==2)输出为F
||	逻辑或	如果符号前或符号后至少有一个为真，返回真	(4>3)||(4>6)输出为T

变量类型与赋值

R语言的变量创建时一般不用声明类型。在计算生物学中，以下五类数据类型最为常见：

类型	解释	举例
character	字符串	“abc”
numeric	浮点数 Inf表示R里的上限 NaN表示像0/0的未定义值	1.02
integer	整型 在赋值时要在数字后面加L，不加默认是numeric	15L
complex	复数	1+2i
logical	逻辑值或布尔值 大小写敏感	T或TRUE F或FALSE

以下的命令用来创建变量并给变量赋值/更新值：

x <- 4
x <- x + 1

这个命令执行后，在Console打x回车，会返回当前变量x的值(5)。在RStudio右侧的Environment里会出线x与它的值(5)。如果要清楚所有变量，请在Console使用以下命令：

rm(list= ls())

复杂一些的数据结构，如vector和data.frame，将在后续使用时讲解。

逻辑判定与循环

R语言的if else、for、while语法和C语言比较类似，具体见下例：

#if(){}else{}
#括号里的条件如果为真，则执行其后花括号内的代码然后结束，否则跳过花括号内代码
#可以在一个if里嵌套另一个if，用来做复杂些的条件判定
#这里的print()函数可以输出括号里的内容
#试试在Console里打?print()或是?加任何你不确定的函数并回车，右下会出现说明
x <- 20
y <- 30
if(x<y && y-x>15){
    
	print("Condition 1")
} else {
    
	print("Condition 2")
}
#输出应为"Condition2"

#for(){}
#按照括号里的范围决定花括号内代码重复执行的次数
#比如下面代码的i in 1:5，意思为i=1，2，3，4，5
#也就是说代码会执行五次
#同样，可以在一个for loop里嵌套另一个for loop
for(i in 1:5){
    
    print(i^2)
}
#输出应为1 4 9 16 25

#while(){}
#循环执行花括号里的代码，直到圆括号的条件为假
#要注意，括号里条件一直为真多话会死循环
x <- 1
while(x < 10){
    
    print(x)
    x <- x + 1
}
#输出应为1 2 3 4 5 6 7 8 9

结束语

R语言入门就到这里啦。下次会具体解释说明vector、matrix、list这几种数据结构，敬请期待！有任何问题或建议欢迎留言和评论！