MOOSE平台使用入门攻略——如何运行官方教程的例子

       本文仅介绍如何运行MOOSE平台官方给出的几个例子（Examples and Tutorials | MOOSE），如何安装MOOSE平台可以参考官方教程（Install MOOSE | MOOSE），本文是基于windows10系统的Ubuntu 20.04虚拟机进行的。 

运行这些例子，可以使用自己构建的app，也可以编译官方给出的例子文件夹的app，为了尽快的跑通例子，这里直接编译例子文件夹中的app。

1、切换moose环境

首先打开Ubuntu，输入

conda activate moose

如果还没有构建moose环境，可以参考（Conda MOOSE Environment | MOOSE），

此时命令行的开头base将转变为moose

 2、编译app

以Ee01为例，这里推荐大家把原始文件在同目录下复制一次，切换工作目录至复制后的文件夹~\projects\moose\examples\ex01_inputfile_copy，然后运行make -j 4编译该目录下的app即可，其中j后面的数字是多少线程进行编译的意思，-j4即为4线程。

cd ~/projects/moose/examples/ex01_inputfile_copy
make -j 4

编译的过程

编译的过程较慢，耐心等待完成即可。

3、运行例子

在app编译完成后，我们就能使用生成的appname-opt文件运行相应的执行文件（name.i），这里使用在ex01_inputfile_copy目录下刚编译的app:ex01-opt，去运行ex01.i，输入命令

./ex01-opt -i ./ex01.i

耐心等待结果即可，求解的模型信息

Framework Information:
MOOSE Version:           git commit cddfe1453b on 2021-12-14
LibMesh Version:
PETSc Version:           3.15.1
SLEPc Version:           3.15.1
Current Time:            Tue May 10 13:34:47 2022
Executable Timestamp:    Tue May 10 13:32:14 2022

Parallelism:
  Num Processors:          1
  Num Threads:             1

Mesh:
  Parallel Type:           replicated
  Mesh Dimension:          3
  Spatial Dimension:       3
  Nodes:                   3774
  Elems:                   2476
  Num Subdomains:          1

Nonlinear System:
  Num DOFs:                3774
  Num Local DOFs:          3774
  Variables:               "diffused"
  Finite Element Types:    "LAGRANGE"
  Approximation Orders:    "FIRST"

Execution Information:
  Executioner:             Steady
  Solver Mode:             Preconditioned JFNK

求解的过程，残差输出

4、结果查看

在本例中，最终输出的文件是ex01_out.e，采用Exodus II格式，该格式可以使用Paraview（Download | ParaView）查看，或者使用Moose平台自带的Peacock（Peacock | MOOSE）。

使用Paraview打开后，第一步在默认界面左下方的Properties选项卡中勾选要查看的变量名称，第二步点击Apply按钮。

第三步在界面上方选择显示的变量，第四步显示求解域的类型（表面、网格或者节点等），对于瞬态模型，还可以对时间步进行调整。

最终的结果展示：

5、备注

在初次编译的过程中，出现错误代码

MAKEFILE：11：*** MISSING SEPARATOR. STOP.

后面打开脚本文件Makefile进行查看，发现为空白，应该是之前使用的过程中，操作失误删除了里面的内容导致。

解决办法：打开MOOSE官网的GitHub库，找到损坏文件的链接，使用GitHub文件下载器（GitHub 文件加速），下载相应的文件，然后替换已经损坏的文件。