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Abnova循环肿瘤DNA丨全血分离,基因组DNA萃取分析
2022-07-07 02:11:00 【Sylvia_sc】
艾美捷Abnova 具备能对ctDNA进行萃取、纯化、文库制备与次世代定序的串流平台。ctDNA液态活检是一种对癌症的鉴定、追踪癌症转型与转移的精准工具,于精准医疗的时代中,此工具对癌症诊断、预后、治疗或是监测均具有重要的临床意义。
艾美捷 Abnova 客制化循环肿瘤DNA工作流程:
样本需求:
人类全血:于室温下至少需有4ml体积全血收集于EDTA管(紫盖)中。
运输:运输过程中需于室温环境下。
DNA制备:在收集的同一天从全血样品的血浆部分中提取基因组DNA,并在4℃下储存。
艾美捷Abnova全血分离,基因组DNA萃取,样本库制备,次世代定序和基因突变分析:
DNA萃取:从血浆层中提取基因组DNA,然后进行DNA纯化和定量。
文库制备:将基因组DNA的片段和尺寸化后转换为双链DNA,再连接寡核苷酸衔接子,并定量样本库的产物。
次世代定序:对感兴趣的突变基因内热点与外显子的定序。
基因突变分析:利用已发表的文献和公共数据库对癌症基因突变与种系变异进一步注释与比较。
分析方法:
次世代定序 (Abnova NGS Solution)
Abnova 循环肿瘤细胞报告交付(14个工作天内):
提供一份癌症基因突变的解释报告。
用于辨识癌症基因突变的基因
利用次世代定序所得到的癌症基因突变的基因序列以及基因不同变异中的基因序列
对癌症突变的注释以及其与已知数据的比较
按客户的要求所进行另外的突变基因定序
项目/内容:
1、癌症基因
与肿瘤有关的可操作基因项目 V2——癌症基因与变异
ALK KIT
BRA FKRAS
EGFR NRAS
ERBB2 PDGFRA
ERBB3 PIK3CA
ESR1 RAF1
2、与肿瘤有关的可操作基因项目 V3——癌症基因与变异
AKT1 GNA11
ALK GNAQ
BRAF HRAS
CTNNB1 KIT
DDR2 KRAS
EGFR MAP2K1
ERBB2 MAP2K2
ERBB3 MET
ERBB4 NOTCH1
ESR1 NRAS
FBXW7 PDGFRA
FGFR1 PIK3CA
FGFR2 RAF1
FGFR3 SMAD4
FLT3 STK11
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